Skip to content

Varian Covid-19: Lima hal yang perlu diketahui tentang bagaimana virus corona berkembang

📅 March 30, 2021

⏱️9 min read

Virus Sars-CoV-2 berubah dengan cara yang membuatnya lebih mudah menular, meningkatkan keparahan penyakit yang ditimbulkannya dan memungkinkannya menginfeksi orang yang seharusnya memiliki kekebalan. Varian ini menimbulkan kekhawatiran di kalangan ahli kesehatan global, terutama karena ada tanda-tanda bahwa beberapa vaksin mungkin kurang efektif melawannya.

img

Varian yang paling memprihatinkan di seluruh dunia pada dasarnya masih virus yang sama dan menyebabkan penyakit yang sama. Kredit gambar - Erik Mclean / Unsplash

Berikut lima hal yang perlu diketahui tentang varian baru Covid-19:

  1. Virus selalu berubah tetapi kadang-kadang membuat lompatan evolusioner

Setiap kali virus Covid-19 menginfeksi seseorang, virus tersebut membajak mesin biologis sel mereka untuk membuat salinan dirinya sendiri. Seringkali materi genetik yang dibawa virus disalin secara tidak benar, menghasilkan apa yang dikenal sebagai mutasi. Sebagian besar virus dengan mutasi mati, tetapi beberapa menginfeksi sel lain di tubuh dan akhirnya orang lain.

Virus terus berkembang, jadi kami berharap untuk melihat akumulasi perubahan dari waktu ke waktu, '' kata Dr Erik Volz, seorang ahli epidemiologi yang mempelajari evolusi penyakit menular di Imperial College London di Inggris.

Kadang-kadang, salah satu dari kesalahan genetik ini dapat menyebabkan perubahan yang menguntungkan bagi virus, seperti memungkinkannya masuk ke dalam sel dengan lebih mudah, menghasilkan lebih banyak salinan dari dirinya sendiri atau membiarkannya menghindari respons kekebalan orang yang terinfeksi.

Pada awal pandemi, salah satu mutasi tersebut menyebabkan virus Covid-19 menjadi lebih mudah menular dengan meningkatkan jumlah virus yang diproduksi oleh orang yang terinfeksi, menurut penelitian oleh Dr Volz dan rekan-rekannya. Perubahan itu juga tampaknya telah menyebabkan virus menginfeksi lebih banyak orang yang lebih muda daripada sebelumnya.

Kami tidak tahu di mana ini pertama kali muncul, tetapi tampaknya ada beberapa kejadian di China dan Eropa, '' kata Dr. Volz. Ketika versi virus ini diketahui pada Maret 2020, 'itu sudah menyebar dengan cepat ke seluruh dunia,' tambahnya.

Pada bulan Juni, virus itu telah menjadi varian virus yang dominan dalam pandemi. Apa yang terjadi dalam genom virus telah membuatnya lebih bugar secara evolusioner daripada bentuk. SARS-CoV-2 sebelumnya.

Beberapa bulan kemudian, virus Covid-19 mengalami perubahan yang lebih dramatis yang terus berlanjut selama pandemi. Ini adalah varian baru yang menunjukkan tidak hanya satu perubahan pada protein lonjakan, tetapi beberapa mutasi penting. Yang pertama terdeteksi adalah varian B117 yang diidentifikasi dalam sampel yang diambil di Kent, tenggara Inggris, pada Desember 2020. Versi baru virus ini telah mengakumulasi 17 mutasi terpisah dalam waktu yang sangat singkat dan meningkatkan kecepatan mutasi. itu menyebar .

Kemunculan varian baru sedikit mengejutkan, '' kata Dr. Volz. "Kami tidak menyangka B117 akan muncul dengan perubahan langkah besar dalam transmisibilitasnya."

  1. Ini adalah varian SARs-CoV-2, bukan strain baru

Tak lama setelah B117 terdeteksi, versi lain dari virus dengan beberapa mutasi serupa - tetapi juga beberapa mutasi penting yang berbeda - terlihat menyebar di Afrika Selatan dan kemudian yang lain ditemukan menyebar di Brasil . Ini akan menjadi masing-masing dikenal sebagai B1.351 dan P1 . Keduanya memiliki mutasi yang memungkinkan mereka untuk menginfeksi kembali orang yang seharusnya memiliki kekebalan setelah infeksi atau vaksinasi sebelumnya .

Sementara beberapa laporan berita menggambarkan versi baru virus Covid-19 ini sebagai 'strain', lebih akurat untuk menggambarkannya sebagai 'varian', kata Dr Volz. Sebagian dari masalahnya adalah bahwa 'strain' virus tidak memiliki definisi yang diterima secara luas.

Varian, sebagai perbandingan, biasanya didefinisikan sebagai versi virus yang memiliki perubahan genetik yang berbeda dari urutan aslinya ketika Covid-19 diidentifikasi. Ketika mengambil perubahan atau serangkaian perubahan yang membentuk cabang baru dari pohon keluarga epidemiologisnya, ini dikenal sebagai garis keturunan. Kata 'strain' digunakan untuk virus yang memiliki sifat yang sangat berbeda, tambah Dr Volz, seperti perbedaan yang signifikan pada protein yang dibawanya atau perubahan perilakunya.

Saat ini, varian yang paling menimbulkan kekhawatiran di seluruh dunia pada dasarnya masih virus yang sama dan menyebabkan penyakit yang sama, tetapi seiring berkembangnya SARS-CoV-2, hal itu pada akhirnya dapat berubah begitu banyak dibandingkan dengan virus aslinya, sehingga mungkin dianggap sebagai virus. strain baru.

img

'Ini menunjukkan ada beberapa evolusi konvergen yang terjadi - bahwa mereka mungkin mendaki bukit kebugaran (evolusioner) yang sama.'

Dr Erik Volz, Imperial College London, Inggris

img

  1. Kasus infeksi kronis dan tingkat kekebalan populasi yang lebih tinggi mungkin telah memungkinkan virus untuk berkembang

Bagaimana tepatnya varian ini muncul masih belum jelas, tetapi para ilmuwan memiliki beberapa petunjuk. Saat memantau orang yang menderita infeksi Covid-19 yang berlangsung lama - dikenal sebagai infeksi kronis - para peneliti telah melihat virus mengambil banyak perubahan pada setiap pasien , termasuk beberapa mutasi yang terlihat pada varian baru.

Virus dapat terus bereplikasi di dalam tubuh mereka selama berbulan-bulan, mengalami mutasi saat itu juga. Ada juga beberapa indikasi bahwa virus mungkin belajar menghindari pengobatan tertentu, seperti plasma penyembuhan, di mana antibodi diambil dari darah orang yang telah pulih dari Covid-19 dan diberikan kepada pasien yang sakit parah. "Itu adalah situasi yang kami tahu dapat menghasilkan virus hiper-mutasi ini karena virus akan mengoptimalkan replikasinya di dalam host."

Varian seperti B117 mungkin mengalami beberapa mutasi pada pasien yang sakit kronis dengan cara ini dan kemudian melarikan diri ke masyarakat dengan menginfeksi orang lain, tambah Dr Volz.

Apa yang menarik perhatiannya, bersama dengan ahli virologi dan ahli epidemiologi lainnya, adalah bahwa varian tersebut tampaknya memiliki beberapa mutasi yang sama di berbagai belahan dunia pada waktu yang bersamaan. Semua varian menunjukkan beberapa mutasi pada protein lonjakan , sebuah molekul yang berada di permukaan berminyak virus. Ini memainkan peran kunci dalam membantu virus masuk ke dalam sel, dan juga merupakan bagian yang menjadi sasaran sebagian besar vaksin.

Ada beberapa perubahan pada bagian protein lonjakan yang semua varian baru miliki, kata Dr Volz. 'Ini menunjukkan ada beberapa evolusi konvergen yang terjadi - bahwa mereka mungkin mendaki bukit kebugaran (evolusioner) yang sama.'

Peningkatan tingkat kekebalan di beberapa negara mungkin menyebabkan perubahan ini terjadi secara independen pada beberapa kesempatan, jelas Dr. Volz. Seleksi alam akan menyebabkan varian yang lebih beradaptasi untuk menghindari kekebalan manusia menjadi lebih umum.

  1. Pengurutan memainkan peran penting dalam melacak varian baru

Satu keuntungan utama selama pandemi Covid-19 dibandingkan dengan pandemi di masa lalu adalah tingkat pengawasan ilmiah yang telah dilakukan terhadap virus berkat pengurutan genetik. Pengurutan kode genetik virus dalam sampel yang diambil dari pasien memungkinkan para ahli melacak virus saat virus itu menyebar dan dengan cepat menemukan varian baru saat muncul.

"Kami tidak pernah memiliki sistem pengawasan genom seperti ini," kata Dr. Volz. "Maksudku, setahun yang lalu, kupikir itu fiksi ilmiah."

Deteksi cepat ini memungkinkan otoritas kesehatan dan pemerintah mengambil langkah cepat untuk mengontrol penyebaran varian dengan tindakan penguncian dan pembatasan perjalanan, misalnya. 'Gagasan bahwa dalam satu bulan varian mulai beredar, itu dapat dideteksi dan kemudian mengarah pada perubahan kebijakan - itu benar-benar belum pernah terjadi sebelumnya,' kata Dr. Volz.

Namun terlepas dari ini, jelas juga bahwa virus tersebut masih bergerak lebih cepat daripada yang dapat ditanggapi oleh pihak berwenang . Varian B117 kini telah dilaporkan di sekitar 114 negara sedangkan B1.351 telah terdeteksi di 67 negara dan P1 di 36 negara . Dan mereka semua mungkin masih tersebar luas karena banyak negara tidak memiliki pengawasan dan pengurutan yang ketat.

Karena itu, varian kekhawatiran mungkin menyebar tanpa disadari, kata Dr Volz.

Para peneliti yang mengambil bagian dalam proyek MOOD menggunakan data lokasi anonim yang diambil dari Twitter dan ponsel untuk melacak pola perjalanan dari Inggris, Afrika Selatan, dan Brasil antara Oktober dan Desember 2020, waktu ketika masing-masing varian yang menjadi perhatian diperkirakan mulai menyebar. . Mereka menemukan korelasi yang kuat antara destinasi dengan wisatawan terbanyak dari masing-masing dari tiga negara ini dan lokasi di mana varian tersebut kemudian ditemukan.

"Jika Anda ingin mengontrol penyebaran varian ini, negara-negara perlu memantau secara dekat perubahan genom virus," kata Dr Shengjie Lai, peneliti senior di University of Southampton, Inggris, yang memimpin penelitian.

  1. Vaksin sudah diubah untuk menangani varian

Dengan beberapa vaksin Covid-19 sudah menunjukkan tanda-tanda kurang efektif terhadap varian B1.351 dan P1 , beberapa produsen telah mulai mengembangkan suntikan penguat yang akan memberikan kekebalan ekstra terhadap versi virus ini.

Tetapi kemungkinan besar vaksin harus terus diperbarui seiring perkembangan virus. Sudah ada beberapa kasus di Inggris tentang varian B117 yang mengalami mutasi yang dianggap bertanggung jawab atas kemampuan virus untuk kebal terhadap antibodi di P1 dan B1.351. Ada varian lain yang menyebar di California , AS, misalnya, yang membawa mutasi yang dapat menimbulkan masalah di kemudian hari dengan menyebabkan infeksi ulang.

"Ada daftar varian yang sedang diselidiki dan kemungkinan beberapa di antaranya akan menjadi varian yang dikhawatirkan," kata Dr Volz. Virus telah menunjukkan bahwa ia memiliki kemampuan untuk menjadi lebih mudah menular dan melepaskan diri dari kekebalan. Dengan proporsi yang cukup besar dari populasi dengan kekebalan baik dari infeksi atau vaksin, akan ada lebih banyak tekanan untuk memunculkan varian melarikan diri. '

Kelompok risetnya sendiri telah memodelkan evolusi SARS-CoV-2 untuk membantu orang lain dalam proyek CoroNAb menghasilkan perawatan antivirus melawan virus corona. Jika virus berubah cukup banyak untuk dapat menghindari sistem kekebalan dari mereka yang telah menerima vaksin, pengobatan anti-virus dapat menjadi cara penting untuk mengendalikan penyakit sampai vaksin baru dapat dikembangkan.

"Kami juga dapat menggunakan data perjalanan kami untuk melihat seberapa efektif tindakan intervensi tertentu," tambah Dr Lai. Ini dapat membantu pemerintah menemukan cara terbaik untuk tidak hanya mengendalikan varian Covid-19 baru, tetapi juga penyakit lain di masa depan. ''

← PrevNext →
  • Powered by Daily Planet News